Jørn Holm-Hansen er dr. polit. i statsvitenskap. Hovedfokuset for forskningen hans er politisk og administrativ reform i Russland, Vest-Balkan og EU’s østlige medlemsland. Han har fulgt utviklingen av flere politikkområder i Øst-Europa siden tidlig 1990-tall, blant dem miljøvern, klimatilpasning, lokalforvaltning, velferdspolitikk samt nasjonalitetspolitikk.
Gjennom å lede og delta i evalueringer og gjennomganger har Holm-Hansen utvidet det geografiske virkefeltet sitt slik at det nå også omfatter Norge og land i Sør.
Holm-Hansen interesserer seg for teorier om politikkoverføring, og da spesielt overføring av utenlandske politiske og administrative institusjoner til land øst i Europa og til landene i det globale Sør. Han stiller spørsmålet om hvilke forutsetninger som må være på plass for at slik overføring bidrar til utvikling og demokratisering, noe som gjør at Holm-Hansens metodebruk stort sett er kvalitativ med mye bruk av systematiske case-studier. Når han gjennomfører evalueringer og gjenomganger, bruker han programteori og endringsteori som strukturerende begreper.