Hovik er utdannet statsviter, med spesialområde innen studie av offentlig politikk og kommunal forvaltning. Hennes forskningsmessige interesse dreier seg om styringsutfordringer på lokalt nivå og flernivåstyring, med en særlig interesse for miljøpolitikk og –planlegging og bærekraftig utvikling. Sissel Hovik har lang erfaring i studier av implementering av offentlig politikk og i forskningsmessig evaluering av reformer innen offentlig sektor.
De seneste prosjektene hun har vært involvert i har i stor grad dreid seg om å studere ulike forutsetninger for vertikal og horisontal koordinering av offentlig politikk og planlegging for bærekraftig utvikling.
-